La colección de arte FMJJ se gestionada bajo parámetros museográficos en cuanto a criterios de selección de las obras, así como a sus obligaciones y funciones relacionadas con el estudio, la conservación, la programación didáctica, su difusión y su exposición. En este contexto, se lleva cabo una política abierta de préstamos de las obras que conforman sus fondos, siempre que la confluencia de las condiciones de la exposición sean las óptimas y respondan a la finalidad de hacer accesible el patrimonio que se gestiona.